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小黃魚全基因組精細圖譜首次繪製

發布時間:2022-12-01 16:50:00來源: 科技日報

  科技日報訊 (洪恒飛 王夏君 記者江耘)近日,科技日報記者從(cong) 浙江省農(nong) 業(ye) 科學院(以下簡稱浙江省農(nong) 科院)獲悉,該院水生生物研究所小黃魚科研團隊與(yu) 廈門大學、美國奧本大學合作,首次完成了小黃魚全基因組組裝注釋與(yu) 精細圖譜繪製,為(wei) 建立小黃魚基因組選擇育種、培育高產(chan) 抗病優(you) 質良種提供了基因資源和技術手段。相關(guan) 研究論文近日在線發表於(yu) 學術期刊《分子生態學資源》。

  小黃魚是中國重要的海產(chan) 經濟魚,味道鮮美,廣受青睞。隨著小黃魚全養(yang) 殖產(chan) 業(ye) 的擴大和科研的深入,破譯小黃魚基因組,發掘其生長、性別決(jue) 定等相關(guan) 重要功能基因成為(wei) 擺在科研工作者麵前的重要課題。

  “黃魚屬包含東(dong) 海四大海產(chan) 中的小黃魚與(yu) 大黃魚兩(liang) 個(ge) 重要經濟魚類,雖然它們(men) 形態和染色體(ti) 核型相似,但是黃魚屬物種之間的遺傳(chuan) 關(guan) 係尚未明確。”論文第一作者、浙江省農(nong) 科院水生生物研究所(以下簡稱水生所)助理研究員謝慶平博士介紹,本研究結合4類基因組測序技術,構建了小黃魚染色體(ti) 水平的基因組精細圖譜;揭示小黃魚基因組大小為(wei) 706兆,注釋基因為(wei) 25233個(ge) ;進化分析表明小黃魚與(yu) 大黃魚親(qin) 緣關(guan) 係最近,大概在2540萬(wan) 年前開始分化。

  謝慶平介紹,魚類雌雄同體(ti) 和雌雄異體(ti) 的演化方向,在學術界仍然是一個(ge) 有待解決(jue) 的有趣謎團。此次研究通過轉錄組學、比較基因組學以及分子生物學的技術方法,鑒定出dmrt1基因為(wei) 小黃魚的雄性特異性基因,且dmrt1基因序列的演化可以作為(wei) 魚類中雌雄同體(ti) 現象產(chan) 生的生物標記。

  論文通訊作者、浙江省農(nong) 科院水生所所長樓寶研究員表示,小黃魚全基因組的解譯和基因組精細圖譜的繪製,對於(yu) 海洋漁業(ye) 資源保護、小黃魚養(yang) 殖產(chan) 業(ye) 化以及分子遺傳(chuan) 育種技術的研究意義(yi) 重大。

(責編:陳濛濛)

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