首個對葉榕完整基因組發布 為榕屬植物性別演化提供重要資源
【科技前沿】
光明日報北京4月9日電(記者楊舒)對葉榕是一種廣泛分布於(yu) 我國南方的植物。近日,中國農(nong) 業(ye) 科學院深圳農(nong) 業(ye) 基因組研究所農(nong) 業(ye) 基因組學技術研發與(yu) 應用創新團隊發布首個(ge) 對葉榕的完整基因組,修正了此前學界對其基因組測序繪製中存在的大量間隙和組裝錯誤,大幅提升了對葉榕基因組的連續性、完整性和準確性,為(wei) 榕屬植物性別演化提供了重要資源。
據介紹,榕樹是桑科榕屬800多種植物的統稱,廣泛分布於(yu) 熱帶和亞(ya) 熱帶地區。榕屬植物包含6個(ge) 亞(ya) 屬,一半雌雄同株(單棵榕樹上包含正常的雌花和雄花),一半功能性雌雄異株(雌榕樹僅(jin) 含有雌花,雄榕樹包含雄花和短花柱雌花)。其中,對葉榕是聚果榕亞(ya) 屬比較古老的雌雄異株植物,具有明顯的性別分化。從(cong) 生物學角度看,解析對葉榕的基因組對研究榕屬植物性別分化及相關(guan) 生物學性狀和基因功能至關(guan) 重要,然而,此前對葉榕基因組存在大量的信息缺失和組裝錯誤,阻礙了進一步的研究。
在國家自然科學基金等項目的支持下,科研團隊綜合利用多種測序技術,在原有基因組基礎上重新組裝、完善,發布了首個(ge) 對葉榕所有染色體(ti) 端粒到端粒完整無間隙的基因組。該基因組大小371.8兆,所有序列均掛載到14條染色體(ti) 上,成功注釋了26642個(ge) 編碼蛋白基因,經評估,基因組的完整度、連續性和準確性均得到了大幅提升。
另據了解,科研團隊還進一步組裝榕屬植物首個(ge) 完整的性別決(jue) 定區域,鑒定榕樹的性別決(jue) 定基因,並構建對葉榕雄性和雌性花不同發育時期的基因調控網絡,從(cong) 而發現雄花發育的關(guan) 鍵基因。
《光明日報》(2024年04月10日 08版)
版權聲明:凡注明“來源:新利平台”或“新利平台文”的所有作品,版權歸高原(北京)文化傳(chuan) 播有限公司。任何媒體(ti) 轉載、摘編、引用,須注明來源新利平台和署著作者名,否則將追究相關(guan) 法律責任。