【曬曬咱的國之重器14】短視頻丨國家微生物科學數據中心
【曬曬咱的國之重器14】
細菌、病毒、真菌、支原體(ti) 、衣原體(ti) ……
談及它們(men) ,你定會(hui) 避之不及。但是,你知道嗎?在地球生物圈,它們(men) 占據著重要位置——環境、食品、醫藥、健康、工業(ye) 、農(nong) 業(ye) 、化學化工、材料、生物安全,與(yu) 人類存續相關(guan) 的所有環節,幾乎都與(yu) 它們(men) 有關(guan) 。其家族成員還包括放線菌、立克次氏體(ti) 、螺旋體(ti) ……它們(men) ,都是微生物。
微生物研究,是科技界持續關(guan) 注的熱點,也正因此,微生物科學數據成為(wei) 一種重要戰略資源。
2019年6月,作為(wei) 我國首批啟動的20個(ge) 國家科學數據中心之一,依托中科院微生物研究所,與(yu) 中國疾控中心傳(chuan) 染病所、中科院海洋所、中科院上海植物生理生態研究所、中科院計算機網絡信息中心等單位共建的國家微生物科學數據中心,開始承擔起保存、整合、挖掘、利用微生物科學數據的重大使命。
模式微生物、基因序列、標本、菌種……從(cong) 開始的自有數據共享,到如今,國家科技計劃匯交數據、期刊數據、華大基因等測序公司數據源源不斷地匯集,你能想象嗎?這裏,已匯集數據條數超過40億(yi) 、3PB;這裏,已成為(wei) 我國最重要、在世界上有極大影響力的微生物科學數據中心。
不僅(jin) 如此,國家微生物科學數據中心還製定了第一個(ge) 微生物數據領域的國際ISO數據標準,覆蓋資源、物種、組學、功能等方麵的數據管理與(yu) 發布。他們(men) 還在此基礎上開發了擁有自主知識產(chan) 權的數據管理平台,在國內(nei) 外上百家單位使用。
中心主任、中科院微生物所研究員馬俊才時常會(hui) 被問到這樣一個(ge) 問題:“國際上已經有GENBANK、GISAID等比較知名的微生物數據庫,如果科學是無國界的,為(wei) 什麽(me) 我們(men) 還要建立自己的數據庫?”
馬俊才的回答總是耐心而堅定——
“國家微生物科學數據中心與(yu) 這些數據庫從(cong) 來不是非此即彼的關(guan) 係,它的建立,既是為(wei) 了保障國家微生物數據主權,也是為(wei) 了依法依規推動數據共享和國際交流。”
馬俊才說,目前幾家比較大的數據庫均在國外,數據收錄和公布的流程比較複雜、時間比較長,有些數據庫的下載還要收費。
“我們(men) 國家財政支持的科研所產(chan) 生的數據,中國科學家使用還得給別人交錢,這合理嗎?”
好消息來了!馬俊才說,作為(wei) 國家科技資源共享服務平台,中心數據資源全部免費共享,“這從(cong) 某種程度上解決(jue) 了我國科學家不能使用我國數據的窘境”。
有了科學數據,還要讓數據“活”起來——
國家微生物科學數據中心在數據的加工整理和分析挖掘上下了大功夫。馬俊才說,他們(men) 以國家微生物科學數據中心為(wei) 依托,與(yu) 國家食品安全領域開展合作,建立了國家食源性致病微生物全基因組數據庫及溯源網絡,對31個(ge) 省區市的60種食品基質、9000株細菌、500株真菌、500株病毒的菌種進行測序,並建立了相應的大數據平台和應用係統,保障國家食品安全。
接下來的目標是什麽(me) ?馬俊才說:“我們(men) 也在不斷提升自己的能力和國際影響力,建立更多數據標準、牽頭國際重大合作計劃,爭(zheng) 取吸引更多國內(nei) 、國際科學家把科學數據提供給我們(men) ,建立更多具有國際權威的微生物數據庫。”
(2022年01月04日 01版)
監製:張寧 廖慧
策劃:李方舟 李宜蒙
配音:張悅鑫
剪輯:董大正
製作:光明網新聞中心
采訪:光明日報全媒體(ti) 記者 齊芳
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