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中國發布荷斯坦牛中高密度基因組選擇育種芯片

發布時間:2023-09-20 16:55:00來源: 人民網-湖南頻道

  人民網長沙9月15日電 一張全基因組育種芯片上均勻分布超12萬(wan) 個(ge) 基因位點,平均檢出率達99.5%,重複樣品檢測平均一致性達99.4%,盲樣檢測性能良好,達到國際先進水平……近日,中國荷斯坦牛中高密度基因組選擇育種芯片發布,標誌著我國荷斯坦牛中高密度育種芯片自主設計開發取得重要突破。

  據悉,荷斯坦牛是當前世界奶牛的主要品種,作為(wei) 單胎大型動物,選擇出優(you) 秀種公牛是奶牛育種的核心工作。目前,國際上已進入奶牛基因組選擇育種時代,使用中高密度育種芯片,能使種公牛培育周期由約6年縮短至約2年,育種效率顯著提升。

  “十四五”國家重點研發計劃項目首席科學家、中國農(nong) 業(ye) 大學教授孫東(dong) 曉就表示,我國近年來加速構建和優(you) 化奶牛基因組選擇育種技術平台,但過去完全依賴國外育種芯片,國內(nei) 種牛檢測樣品需要送到國外實驗室檢測,存在技術“卡點”及生物信息安全風險。

  在奶牛基因組選擇育種時代,高通量SNP檢測技術平台堪稱育種“芯片”,為(wei) 實現我國國產(chan) 奶牛育種芯片零的突破,2020年8月,首農(nong) 食品集團北京奶牛中心、中國農(nong) 業(ye) 大學、華智生物技術有限公司啟動奶牛育種芯片自主設計開發聯合攻關(guan) 。

  奶牛育種芯片自主開發經曆了一係列科學、嚴(yan) 謹的設計、驗證和反複論證,攻關(guan) 團隊基於(yu) 中國荷斯坦牛群體(ti) 挖掘驗證了一大批效應顯著的基因突變位點,最終自主設計了涵蓋超12萬(wan) 個(ge) 位點(即126K)的育種芯片,該款芯片不僅(jin) 兼容現有參考群和多款商業(ye) 化芯片位點信息,還提高了芯片數據填充準確性及奶牛基因組遺傳(chuan) 評估準確性。

  奶牛126K液相基因組育種芯片通過了專(zhuan) 家論證,專(zhuan) 家組認為(wei) 芯片設計科學合理,經過檢測驗證、盲樣複檢、多平台對比、填充效果驗證等多輪測試,驗證程序完善。參照國際同類產(chan) 品標準,達到產(chan) 業(ye) 化推廣應用水平,可用於(yu) 荷斯坦牛基因組選擇參考群體(ti) 的構建及種牛評價(jia) 。

  “這是我國荷斯坦牛育種領域首款中高密度育種芯片,對提升我國種公牛自主培育能力和水平,進一步完善奶牛種質自主評價(jia) 體(ti) 係具有重要意義(yi) 。”中國奶業(ye) 協會(hui) 副秘書(shu) 長陳紹祜說。

  中國奶業(ye) 協會(hui) 育種專(zhuan) 業(ye) 委員會(hui) 主任麻柱說,奶牛育種自主創新聯盟將率先用上這款芯片,助力保障我國奶牛自主選育體(ti) 係穩定運行,維護生物信息安全,並將進一步提升我國奶牛自主選育能力,助力奶牛種業(ye) 振興(xing) 。(林洛頫、龍宇)

(責編:李文治)

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