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我國科研團隊建成“數字家蠶”共享分析平台

發布時間:2023-11-14 15:13:00來源: 新華網

  記者從(cong) 西南大學資源昆蟲高效養(yang) 殖與(yu) 利用全國重點實驗室獲悉,實驗室代方銀教授團隊取得最新科研成果——“數字家蠶”共享分析平台,對於(yu) 推動家蠶泛基因組成果在功能基因組、基因組選擇和分子設計育種等方麵的研究應用具有重要意義(yi) 。相關(guan) 研究成果近日在國際學術期刊《核酸研究》在線發表。

  在現代蠶學研究和育種實踐中,泛基因組序列和多組學數據已經成為(wei) 科學家手中不可或缺的基礎資源,可以縮短研究和育種的時間,顯著提高工作效率。然而,多組學大數據的整合分析和使用具有成本高、技術難度大的特點。

  代方銀介紹,分析平台不僅(jin) 涵蓋家蠶基因序列信息,還整合了家蠶基因表達、調控、功能研究等數據,提供了開展比較基因組和功能基因組等方麵研究的分析工具。

  這是繼2022年該團隊發布家蠶超級泛基因組圖譜後,推動創建“數字家蠶”取得的又一重大進展。分析平台整合了家蠶泛基因組序列及多組學數據,將一個(ge) 具有上千個(ge) 種質資源的線下實體(ti) 基因資源庫轉化為(wei) 組學序列數據庫並搬上互聯網,實現種質資源基因組、遺傳(chuan) 變異及表型等數據的開放共享和可視化分析。

  “我們(men) 將它比喻為(wei) 一部智能、高效的家蠶基因‘數字字典’或超級‘圖書(shu) 館’,研究人員能在這裏快速獲取家蠶基因組相關(guan) 信息。”西南大學資源昆蟲高效養(yang) 殖與(yu) 利用全國重點實驗室博士後陸昆鵬說。(記者周思宇)

(責編:常邦麗)

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