科技日報訊 (通訊員許娟 趙月 李寧 記者朱彤)由新疆農(nong) 科院加工番茄生物育種創新團隊牽頭，聯合中國農(nong) 業(ye) 科學院、新疆大學、新疆農(nong) 業(ye) 大學等多家單位，成功構建了國際首個(ge) 番茄超泛基因組。4月6日，相關(guan) 科研成果以《超泛基因組研究揭示野生和栽培番茄物種基因組和結構變異多樣性》為(wei) 題在線發表於(yu) 國際學術期刊《自然·遺傳(chuan) 》。

　　番茄(Solanum lycopersicum L.)是果實遺傳(chuan) 、發育和生理研究的經典模型係統，也是全球生產(chan) 中最重要的蔬菜作物。由於(yu) 人們(men) 為(wei) 追求更大的果實和更高的產(chan) 量，對栽培番茄進行密集人工選擇，致使目前番茄遺傳(chuan) 多樣性大幅喪(sang) 失，改良過程存在嚴(yan) 重瓶頸。相比之下，野生番茄在各生態環境下表現出廣泛的遺傳(chuan) 和表型多樣性，其豐(feng) 富的等位基因變異、更強的耐生物脅迫和非生物脅迫性、高水平的可溶性固體(ti) 含量、番茄紅素和風味化合物以及高分枝能力對現代育種具有重要意義(yi) 。

　　該團隊研究收集了8個(ge) 野生番茄種、1個(ge) 番茄近源野生種和2個(ge) 栽培番茄代表性品種，利用PacBio(第三代單分子實時測序技術)、Bionano(全基因組光學圖譜技術)和Hi-C(高通量染色體(ti) 構象捕獲技術)測序技術，組裝了11個(ge) 染色體(ti) 水平高質量基因組，解析了番茄屬基因組特征，重構了番茄屬係統發生關(guan) 係，構建了國際首個(ge) 番茄超泛基因組，為(wei) 群體(ti) 水平SV基因分型提供了強大的平台，這將有助於(yu) 開發風味改良番茄品種的育種標記。

　　該團隊利用超泛基因組，在野生番茄資源中克隆到一個(ge) 能顯著增加分枝數且果實數量增加67.1%的新基因，對今後加工番茄品種創新具有重大價(jia) 值，也為(wei) 其他農(nong) 作物開展生物育種基礎前沿研究提供了新思路，為(wei) 加快新品種選育進程開辟了新方向。