我科學家開發出具有自主知識產權的基因編輯技術
基因編輯技術是麵向未來的關(guan) 鍵技術之一,能否擁有自主知識產(chan) 權的基因編輯技術,是這一領域國際競爭(zheng) 的核心。我國科學家在這一方向又建新功——中國科學院遺傳(chuan) 與(yu) 發育生物學研究所高彩霞研究組研發出一係列新的堿基編輯係統,是具有我國自主知識產(chan) 權的精準基因編輯技術,有望打破堿基編輯底層專(zhuan) 利壟斷,將幫助我國在未來的生物技術產(chan) 業(ye) 競爭(zheng) 中處於(yu) 有利地位。相關(guan) 研究成果27日在線發表於(yu) 國際學術期刊《細胞》。
蛋白質是生命活動的主要承擔者,對蛋白質進行功能聚類,是理解其參與(yu) 的生理過程、設計新型蛋白質等的重要手段。高彩霞介紹:“現有的方法主要基於(yu) 氨基酸一級序列的相似性對蛋白質進行聚類分析,並以此推斷其功能和演化關(guan) 係。然而,蛋白質功能由其三維空間結構所決(jue) 定,開發基於(yu) 三維結構的高通量蛋白質聚類方法,將為(wei) 蛋白質功能研究提供更直接、可靠的手段,並推動未知蛋白質的功能挖掘。”
“現有的堿基編輯係統在蛋白質研究上有很多局限,而且底層專(zhuan) 利由國外持有。”高彩霞說,“由於(yu) 脫氨酶是堿基編輯係統的核心元件,因此,我們(men) 將研究聚焦於(yu) 挖掘自主知識產(chan) 權的新型脫氨酶,以開發適用於(yu) 不同應用場景的新型堿基編輯工具。”
研究中,科研人員發現當蛋白集合的序列同源性較低且功能多樣時,相比於(yu) 傳(chuan) 統的基於(yu) 氨基酸一級序列的聚類方法,通過AI輔助的蛋白質結構聚類能夠得到更準確的結果。因此,該方法能為(wei) 蛋白質功能分析和挖掘提供一個(ge) 高效、可靠的新策略。
研究人員基於(yu) 進一步蛋白質結構聚類的結果,鑒定到全新的45個(ge) 單鏈胞嘧啶脫氨酶(Sdd)和13個(ge) 雙鏈胞嘧啶脫氨酶(Ddd),開發了一係列新型堿基編輯係統,並在動、植物細胞中進行了測試。結果表明,這一新型堿基編輯係統具有更高的編輯活性和編輯效率,突破了現有脫氨酶的應用瓶頸,展現出新型堿基編輯係統在醫學和農(nong) 業(ye) 方麵廣泛的應用前景。
有評論認為(wei) ,研究組創新性地運用AI輔助的大規模蛋白結構預測,建立起全新的基於(yu) 三級結構的高通量蛋白聚類方法,實現了脫氨酶功能結構的深入挖掘,鑒定到完全區別於(yu) 已知脫氨工具酶的全新底盤元件,並開發了一係列具有我國自主知識產(chan) 權的新型堿基編輯工具,為(wei) 蛋白功能分析、新功能元件挖掘提供了全新策略。(記者 齊芳)
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