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蛋白質結構也能預測?看人工智能如何“神機妙算”!

發布時間:2022-08-04 08:43:00來源: 央廣網

  央廣網北京8月3日消息 據中央廣播電視總台中國之聲《新聞超鏈接》報道,總部位於(yu) 英國的人工智能公司“深層思維”日前宣布,該公司開發的人工智能程序“阿爾法折疊”已預測出約100萬(wan) 個(ge) 物種的超過2億(yi) 種蛋白質的結構,涵蓋科學界已編錄的幾乎每一種蛋白質。

  據介紹,這些信息將上傳(chuan) 至可公開訪問的“阿爾法折疊蛋白質結構數據庫”。這些數據已經在瘧疾疫苗開發、對抗抗生素耐藥性與(yu) 塑料汙染等場景中得到應用,並且幫助研發人員加速新藥研發。

  “阿爾法折疊”是如何進行預測的?蛋白質能被設計改造嗎?我國科學家在這一領域正在進行哪些科研攻關(guan) ?

  

  不是所有人工智能都能預測蛋白質結構!

  人工智能可以完成很多事情——在圍棋對弈中戰勝柯潔的“阿爾法狗”,我們(men) 熟悉的智能算法、自動駕駛、機器寫(xie) 作等都離不開人工智能技術的支持。

  而這次引發關(guan) 注的人工智能程序“阿爾法折疊”與(yu) “阿爾法狗”一樣,同屬於(yu) 人工智能公司“深層思維”。

  幾十年來,根據氨基酸序列確定蛋白質3D形狀一直是生物學領域的一大難題。北京航空航天大學教授、結構生物學家、中國生物物理學會(hui) 科普工委秘書(shu) 長葉盛介紹,基因與(yu) 蛋白質之間好像存在著一種一一對應的關(guan) 係,但是這個(ge) 對應關(guan) 係到底是什麽(me) ?直到今天,科學界仍舊沒能在學術上找到公式去描述該折疊過程。

  麵對這樣的問題,人工智能可以發揮作用。葉盛表示,現在已經獲得的蛋白質結構隻有18萬(wan) 個(ge) 左右,但“阿爾法折疊”通過這18萬(wan) 個(ge) 結構的一一對應的關(guan) 係去學習(xi) ,最終在神經網絡裏學習(xi) 到轉換的規律,能夠準確地預測三維結構。

  人工智能技術由來已久,也有很多公司在做蛋白質結構預測,而“阿爾法折疊”率先成功的訣竅在於(yu) 技術與(yu) 算力積累。

  葉盛解釋:“因為(wei) ‘深度思維’的背後有穀歌提供的算力支持,所以它是用龐大的算力作為(wei) 支撐,才能完成2億(yi) 多蛋白質結構的預測計算工作。”

  蛋白質能被設計改造?前路漫漫!

  蛋白質的3D形狀或結構決(jue) 定了它在細胞中的功能,如今“阿爾法折疊”已預測出超過2億(yi) 種蛋白質結構,設計改造蛋白質來調整它的功能似乎逐漸“照進現實”。

  葉盛介紹,蛋白質改造其實很早以前就有,上個(ge) 世紀八九十年代,甚至更早,就已經有人在做這方麵的工作,但是早期工作主要集中在化工某步驟的生產(chan) 環節,因此被稱為(wei) 蛋白質工程。

  近年來,人工設計蛋白質成為(wei) 新的方向,葉盛說:“我們(men) 在嚐試,不僅(jin) 是用人工智能去預測已有蛋白質的結構,在它學習(xi) 足夠多的蛋白質結構的規律後,還要看它有沒有可能自己設計出一種新的蛋白質。”

  雖然目前人工設計蛋白質還處於(yu) 發展階段,但它具備很多用途和廣闊前景。葉盛表示,如果能夠突破蛋白質設計的環節,未來可能給藥物的市場帶來革命,能夠讓一些新的藥物去解決(jue) 以前解決(jue) 不了的疾病問題。

  明年就能突破?中國蛋白質結構預測已經走到這一步!

  無論是在蛋白質結構預測領域,還是在人工智能領域,中國經過多年發展都已積累許多科研基礎。

  蛋白質藥物是葉盛教授團隊的重要研究方向,他介紹,蛋白質藥物已成為(wei) 藥物市場上飛速發展的領域,它主要解決(jue) 的問題往往是一些小分子藥物無法解決(jue) 的一些重大疾病。抗體(ti) 是分子量非常巨大的蛋白質分子,“我們(men) 在嚐試通過人工智能算法去設計出相對很小的蛋白質,但同時又能夠完成抗體(ti) 藥物的功能”。

  目前在蛋白質設計領域,國內(nei) 與(yu) 國外技術思路不完全一樣。葉盛介紹說,像中科大、中科院計算所等單位都投入力量到蛋白質設計的工作中。

  葉盛也表示:“目前已有一些文章發表在比較有影響力的學術期刊上,我覺得再給一段時間,也許明年,我們(men) 可能就能夠在這個(ge) 領域有一個(ge) 井噴式的發展,湧現出各種各樣不同思路的蛋白質設計算法。”

  監製:郭靜

  記者:鶴佳 劉飛

  編輯:潘雨薇 楊冉

(責編: 郭爽)

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